Obsah
Proteíny sú tvorené z polymérnych alebo aminokyselinových reťazcov. Aminokyselinová sekvencia (spolu s akýmikoľvek modifikáciami) určuje, ktorú proteínovú štruktúru prijme. Proteíny majú štyri štruktúrne úrovne: primárne, sekundárne, terciárne a kvartérne. Primárna štruktúra je len aminokyselinová sekvencia, zatiaľ čo sekundárna štruktúra označuje 3-D štruktúru prijatú segmentmi aminokyselinového reťazca.
Alfa skrutkovica
Alfa helix je veľmi bežný typ sekundárnej štruktúry, v ktorej sa reťazec aminokyselín otáča, aby vytvoril jemnú cievku. Dusík petidnej väzby v každej aminokyseline má na sebe naviazaný vodík, takže môže tvoriť typ interakcie nazývanej vodíková väzba s kyslíkovým atómom karbonylovej skupiny každej väzby. Vodíkové väzby držia vrtuľu pohromade a pomáhajú udržiavať jej tvar.
Bočné reťaze
Všetky bočné reťazce aminokyselín alfa helixu smerujú von, čo vytvára úplnú slučku každých 3,6 aminokyselín. Vrtuľa je skrútená v smere hodinových ručičiek, takže je niekedy označovaná ako "pravá". Proteín môže obsahovať niekoľko alfa helixov a niektoré proteíny, ako napríklad keratín (proteín nájdený vo vlasoch a nechtoch) majú tento typ štruktúry vo väčšine svojich dĺžok.
Beta listy
Blistový list je tiež držaný pohromade vodíkovými väzbami, ale v tomto prípade sú dve oblasti polypeptidu umiestnené vedľa seba a vodíkové väzby ich držia pohromade v druhu skladaného hárku papiera. Párované vodiče sa môžu otáčať buď v opačných smeroch, v takom prípade sú antiparalelné, alebo môžu byť paralelné, pričom obidve pramene majú rovnaký smer. Antiparalelné usporiadanie je bežnejšie. Bočné reťazce aminokyselín alternatívne smerujú nahor a nadol, kolmo na rovinu listu.
úvahy
Polypeptidy môžu obsahovať niekoľko beta listov a časti alfa helixu ako časti ich celkovej 3-D štruktúry alebo terciárnej štruktúry. Jediný polypeptid môže byť samotný proteín alebo niekoľko sa môže viazať na vytvorenie proteínu. Ak sa jedná o viac polypeptidov, ich priestorové usporiadanie sa nazýva kvartérna štruktúra. Sekundárna štruktúra sa špecificky vzťahuje na charakteristiky alfa helixu a beta listu. Ako terciárne a kvartérne štruktúry sa sekundárna štruktúra môže stať poruchou alebo denaturáciou použitím vysokých teplôt a / alebo významných zmien pH.