Obsah
Chemické zlúčeniny cetyltrimetylamónium bromid, hexadecyltrimetylamónium bromid, palmityltrimetylamónium bromid a cetrimonium bromid sú známe aj CTAB. Chemikália sa používa ako udržovač pH v sekvenčnom genóme DNA, najmä v rastlinách.
Mletie rozbije bunkové steny rastlín na extrakciu DNA (Jason Reed / Ryan McVay / Digital Vision / Getty Images)
Vzorec CTAB
Množstvo vzorcov rôznych chemikálií CTAB sa líši v závislosti od laboratória. Všetky zložky však zahŕňajú 1 M Tris HCl pH 8,0, 0,5 M EDTA, 5 M NaCl a H20 (niekedy dvakrát destilované). V prípade CTAB zložky niektoré laboratóriá používajú cetyltrimetylamónium bromid a ďalšie hexadecyltrimetylamónium bromid.
Príprava rastlinných tkanív
Príprava rastlinného tkaniva sa môže líšiť v závislosti od materiálu. Steny a bunkové membrány sa musia rozbiť, aby sa získal prístup k jadrovému materiálu bez akejkoľvek degradácie. Normálne pri mletí umožňuje rastlinný materiál s tekutým dusíkom prístup k DNA, pričom sa udržujú škodlivé bunkové enzýmy a neaktívne chemikálie.
Suspenzia a odstredenie
Rozdrvené tkanivo sa umiestni na čepeľ CTAB a vloží sa do misky s tečúcou vodou. Potom sa zmieša s chloroformom a odstredí sa, aby sa oddelili rozpustné proteíny a iné materiály. DNA sa potom vyzráža z vodnej fázy a opatrne sa premyje, aby sa odstránili kontaminujúce soli. Purifikovaná DNA sa potom odoberie a uloží na TE sklíčko alebo sterilnú destilovanú vodu.