Obsah
Peptidy sú fragmenty krátkych polymérov zložených z aminokyselín. Každý peptid má určitú sekvenciu aminokyselín označenú trojpísmenovým kódom alebo iba jednou; napríklad aminokyselina alanín je skrátená ako „Ala" alebo „A". Náplň peptidov v roztoku závisí od jeho kyslosti. Izoelektrický bod (pl) sa týka hodnoty kyslosti roztoku, v ktorom má peptidová molekula čistý náboj rovný nule. Rozpustnosť peptidu je v izoelektrickom bode minimálna. Použite dostupné webové servery na výpočet hodnoty pI pre aminokyselinovú sekvenciu peptidu.
Krok 1
Sekvenujte peptid pomocou jednopísmenového kódu. Napríklad, ak má peptid aminokyselinovú sekvenciu Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanín - serín - kyselina glutámová - leucín - prolín), potom by jednopísmenová sekvencia bola „ASELP“. V prípade potreby si pozrite konverznú tabuľku z jedného na tri písmená v časti Zdroje.
Krok 2
Pomocou ľubovoľného prehľadávača, napríklad Internet Explorer alebo Firefox, zadajte server, ktorý počíta izoelektrický bod peptidu (pI); pozri zdroje.
Krok 3
Zadajte jednopísmenovú sekvenciu peptidu - v našom príklade „ASELP“ - do poľa a kliknite na „Vypočítať“.
Krok 4
Odčítajte hodnotu izoelektrického bodu (pI) uvedenú v riadku „Teoretický pI / Mw“ (teoretický pl). V našom príklade je pi 4,00. Upozorňujeme, že server tiež počíta molekulovú hmotnosť (Mw) peptidu.